Le problème c'est que les mods que je télécharge sur la confrérie des traducteurs ou sur le nexus si j'ai pas le choix (donc les mods en .zip) n'apparaissent pas comme avant dans la section "plugins" de MO comment je peux régler ça ?

Certes, tu n'as plus tes archives, mais les fichiers de tes mods (ceux que MO utilisent pour les faire tourner en jeu) sont encore présents. Il te suffit de récupérer les dossiers en question (en virant le fichier meta.ini dans chacune), refaire une archive avec (en 7z ou .zip, peu importe), et les réinstaller normalement sur ta nouvelle installation de MO.Normalement, les dossiers de chaque mods installés se trouvent dans un des répertoires de MO (dans Mod Organizer/mods).